27 jan. 2003 : N’Djamena et Khartoum signent un accord de sécurité et de coordination politique.
 Fin fév. : Début d’une rébellion armée dans le Darfour (ouest du Soudan). Plus de 240 000 Soudanais se sont depuis réfugiés au Tchad.
 29 jan. 2004 : Raid de l’armée soudanaise sur le secteur tchadien de Tiné, localité située de part et d’autre de la frontière.
 13 fév. : N’Djamena dément toute implication dans la guerre au Darfour.
 6 mai : Le Tchad proteste contre des incursions de milices arabes janjawids combattant aux côtés de l’armée soudanaise.
 26 sept. 2005 : Une attaque du village de Madayoun (est du Tchad) fait 75 morts, selon N’Djamena, qui accuse des miliciens jandjawids.
 3 oct. : Le Tchad ferme son consulat à el-Geneina et celui du Soudan à Abéché (Est).
 23 déc. : Après une attaque contre Adré (Est), le Tchad se dit « en état de belligérance avec le Soudan ».
 8 fév. 2006 : Les présidents tchadien Idriss Deby et soudanais Omar el-Béchir signent à Tripoli un accord prévoyant « l’interdiction d’utiliser le territoire de l’un pour des activités hostiles contre l’autre » et des patrouilles communes sur la frontière.
 13 avr. : Le Tchad dénonce une « agression programmée à partir de Khartoum », après une offensive de rebelles tchadiens sur N’Djamena et dans l’Est. Le Soudan dément toute implication.
 14 avr. : Rupture des relations diplomatiques (normalisées en août). N’Djamena se retire des négociations sur le Darfour.
 9 avr. 2007 : Accrochage entre les deux armées en territoire soudanais. Le Tchad nie toute attaque délibérée.
 3 mai : Accord Deby/el-Béchir en Arabie Saoudite censé mettre fin à la tension.
 29 déc. : Le Soudan dépose une plainte à l’ONU dénonçant des frappes aériennes tchadiennes sur son territoire.
 8 jan. 2008 : Le Tchad reconnaît avoir bombardé des bases rebelles au Soudan et annonce qu’il fera usage de son droit de poursuite.
 29 jan. : N’Djamena accuse le Soudan d’avoir « ordonné » aux rebelles tchadiens installés au Darfour de franchir la frontière pour attaquer l’armée tchadienne.
 2-3 fév. : Le Soudan nie toute implication dans les combats au Tchad après une tentative de renversement du régime à N’Djamena par des rebelles tchadiens.
 13 mars : Les présidents Deby et el-Béchir signent à Dakar un accord de non agression, similaire aux précédents accords.
 1er avr. : Des combats éclatent dans la région d’Adé entre des rebelles tchadiens et les forces gouvernementales. N’Djamena accuse les rebelles d’être passés à l’offensive « sur ordre » de Khartoum.
 Le lendemain, Khartoum accuse l’armée tchadienne d’avoir bombardé un village soudanais du Darfour et affirme qu’une roquette tirée du Tchad a touché une de ses unités militaires.
 11 mai : Au lendemain d’une attaque sans précédent commise par des rebelles du Darfour contre Omdurman, ville jumelle de Khartoum, le Soudan rompt ses relations diplomatiques avec le Tchad, qui dément « toute implication ».